Communautés microbiennes de Thau

La station échantillonnée dans le cadre de l’OSU OREME se trouve sur la lagune de Thau, en face de la Station Méditerranéenne de l’Environnement Littoral (SMEL) de Sète.

Cette station a non seulement été choisie pour des raisons pratiques (accès), mais surtout car elle présente une signature lagunaire caractéristique. De plus, son éloignement des tables conchylicoles environnantes permet de se soustraire au biais d’échantillonnage induit par la pression de filtration des bivalves. Les nombreux programmes d’échantillonnage qui y ont été menés depuis la fin des années 30 permettent d’avoir accès à une série temporelle importante sur cette station, qui renforce la pertinence de l’analyse des données acquises.

L’échantillonnage régulier de la station a été ré-initié par Delphine Bonnet en 2008 et pérennisé jusqu’à décembre 2011 par des contrats de recherche, notamment le projet GELAMED sur le plancton gélatineux (2010-2012, programme Liteau III). Depuis le début de l’année 2013, l’échantillonnage bimensuel de la station est mené dans le cadre du suivi OSU OREME et permet l’analyse de différents paramètres environnementaux et biologiques :

• Température, salinité, profondeur et turbidité
• Sels nutritifs
• Abondance totale des bactéries et HNA (High Nucleic Acid) /LNA (Low Nucleic Acid)
• Abondances du pico-phytoplancton, cyano-bactéries, nano-phytoplancton
• Abondance totale des communautés virales
• Abondance et diversité des communautés mésozooplanctoniques
• Abondance et diversité des communautés proto-zooplanctoniques: flagellés et ciliés
• Abondance et diversité des communautés nano- and microphytoplanctoniques
• Analyse de la chlorophylle a
• Abondance de la méduse Aurelia coerulea
• ADN planctonique total: une banque d’ADN planctonique total a été créée. Deux exemplaires de chaque triplicat réalisé sont conservés à -30°C et disponibles pour analyse pour tout collègue intéressé par un suivi de ce type. Les échantillons sont envoyés sur demande (contacter sandrine crochemore).

Variables Essentielles de Biodiversité : Taxonomic diversity, Population abundance

Publications

• Marques R, Bonnet D, Carré C, Roques C, Darnaude A. 2020. Trophic ecology of a blooming jellyfish (Aurelia coerulea) in a Mediterranean coastal lagoon. Limnology and Oceanography, 66(1):1-17. doi: 10.1002/lno.11593 (IF2020=3.778)
• Marques R, Darnaude AM, Schiariti A, Tremblay Y, Molinero JC, Soriano S, Hatey E, Colantoni S, Bonnet D. 2019. Dynamics and asexual reproduction of the jellyfish Aurelia coerulea benthic life stage in the Thau lagoon (northwestern Mediterranean). Marine Biology, 166:74. doi: 10.1007/s00227-019-3522-4 (IF2019=2.050)
• Marques R, Albouy-Boyer S, Delpy F, Carré C, Le Floc’h E, Roques C., Molinero JC, Bonnet D. 2015. Pelagic population dynamics of Aurelia sp. in French Mediterranean lagoons. Journal of Plankton Research, 37: 1019-1035. (IF2015=1.921)

Communications orales avec actes publiés

• The trophic ecology of Aurelia coerulea in a Mediterranean coastal lagoon. Marques R, Bonnet D, Darnaude AM. 6th Jellyfish Bloom Symposium, 2019, Cape Town, Afrique du Sud.
• Population dynamics and asexual reproduction strategies of the benthic population of the jellyfish Aurelia coerulea in Thau lagoon. Marques R, Darnaude AM, Tremblay Y, Schiariti A, Soriano S, Hatey E, Colantoni S, Bonnet D. 8th European Coastal Lagoons Symposium, 20–23 March 2018, Athènes, Grèce.

Affiches

• Biogeography and phylosymbiosis shape the Aurelia jellyfish bacteriome. Auguet, JC, Restrepo Ortiz CX, Stott S, Bouvier C, Marques R, Bonnet D. IXe Colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne, 2019, Bussang, France.
• Determining Obelia spp. diversity and population dynamics in Thau lagoon (Northwestern Mediterranean Sea, France). Bonnet D, Marques R, Molinero JC, Soriano S, Ligier A, Constensoux J, Colantoni S, Ensibi C, Macaluso V, Torboli V, Pallavicini A, Avian M. 8th European Coastal Lagoons Symposium, Athens, Greece, 20–23 March 2018.
• Aurelia spp. ecology in the Mediterranean Sea. Bonnet D, Molinero JC, Batistic M, Boero F, Daly N, Deidun A, Fuentes V, Golo R, Gueroun S, Hervé A, Isinibilir M, Kienberger K, Kogovsek T, Lucic D, Malej A, Marques R, Miloslavic M, Pascual M, Piraino S, Prieto L, Yilmaz IN, Zampardi S, Zervoudaki T. 8th European Coastal Lagoons Symposium, 20–23 March 2018, Athens, Greece.
• Aurelia spp. Ecology in the Mediterranean Sea. Bonnet D, Molinero JC, Batistic M, Boero F, Daly MN, Deidun A, Fuentes V, Golo R, Gueroun SKM, Hervé A, Isinibilir M, Kienberger K, Kogovšek T, Lučić D, Malej A, Marques R, Miloslavić M, Pascual M, Piraino S, Prieto L, Yilmaz IN, Zampardi S, Zervoudaki S. 5th International Jellyfish Blooms Symposium, 29 May–3 June 2016, Barcelona, Spain.