Fondée en 1879 par Armand Sabatier au même moment que les grandes stations marines de Roscoff, Banyuls, Villefranche ou Monaco, la Station Marine de Sète, rattachée à l’Université de Montpellier, sert depuis l’origine de point d’appui aux recherches, à l’observation et à la formation dans le domaine de la biologie marine.
Le développement des sciences de l’environnement, notamment en domaine marin, confère à cette Station un rôle accru ; elle est en effet le service commun d’accès à l’observation et l’expérimentation en eau de mer (in situ et à terre) pour les Unités de recherche de l’OREME et de l’Université de Montpellier, et par ailleurs elle est membre du réseau national des stations marines.