Système d’Information
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Missions
Les missions de la plateforme sont de :
- Pérenniser les données de l’Observatoire : stockage, sauvegarde, archivage, structuration et description
- Valoriser les données : diffusion, catalogage, référencement
- Améliorer la qualité des données : outils de saisie, d’aide à la saisie, validation, surveillance ..
- Permettre le croisement des données avec des bases de données nationales et internationales, et avec des outils et applications métier
Voir le poster de présentation Voir la plaquette de présentation
Présentations
Présentations des développements et méthodologies du service SI
Compétences
- Conception et développement de bases de données environnementales géoréférencées (PostgreSQL / PostGIS, MySQL)
- Conception et développement de portails web et d’outils de gestion et de diffusion de données (PHP / CodeIgniter, JavaScript, WordPress)
- Conception et développement d’outils cartographiques et rgaphiques sur le web (Geoserver, Leaflet, dygraphs, ..)
- Manipulation et traitement de données (R, Perl)
- Interopérabilité des données et métadonnées : standards de l’OGC, standards métier (Catalogue of Life, WoRMS, BD Carthage, …), thésaurus, ..
- Catalogage et référencement de données (GeoNetwork, DOI, …)
- Administration de serveurs et du stockage (SUSE / Xen, SAN, …)
Services proposés aux laboratoires
Les compétences ci-dessus sont mises au service des laboratoires et la plateforme Système d’Information peut venir en support pour :
- la constitution, la structuration, l’hébergement et la maintenance de bases de données
- le développement de nouveaux outils ou la ré-utilisation d’outils pour la diffusion et la visualisation de données numériques, cartographiques ou multimédia
- le référencement de données : catalogage et attribution de DOI
- le développement de sites web de type « projet »
Outils mutualisables
Différents outils autour de la donnée sont développés avec une perspective de réutilisation, permettant ainsi la mutualisation des moyens.
Outil dynamique et interactif de visualisation et de validation de séries temporelles
Applications R interactives sur le web.
Outils de visualisation cartographique interactive et dynamique sur le web
Galeries de photos sur le web avec recherche multi-critères
Outils pour importer en base ou exporter des données sous format texte
Outils d'alimentation de bases de données en continu
Outils de surveillance et d'alertes sur les données
Outil de gestion de métadonnées sur le web (consultation, ajout, édition, suppression)
Outil de connexion à des bases de données distantes
Outils d'alimentation de portails de données et métadonnées
Outil cartographique de recherche et de normalisation de données d’entités hydrographiques
Outil d'aide à la saisie sur le terrain : carnet de terrain électronique
Catalogage des jeux de données
Attribution et outils de génération automatique de DOI
Réalisations et activités
Constitution de bases de données
Le choix des bases de données prises en charge est actuellement effectué au sein de la plateforme Systèmes d’Information.
Il repose sur la combinaison d’un ensemble de critères tels que la mutualisation des efforts (ré-utilisabilité des développements), les retombées pour l’Observatoire notamment en terme de visibilité, le soutien propre en développement dont disposent les équipes, la motivation de l’équipe quant à la diffusion de ses données et l’intérêt technique (développement de nouveaux outils ou compétences).
Développement de portails web
La plateforme a réalisé le développement de 2 portails de l’OSU OREME :
- le portail institutionnel (oreme.org) basé sur WordPress
- le portail des données (data.oreme.org) basé sur le framework PHP CodeIgniter
Mise en place d’un ensemble de serveurs pour héberger les services applicatifs de l’Observatoire
L’Observatoire met en place un ensemble de services de gestion des données. Il administre notamment :
- un serveur de machines virtuelles (sous SUSE / Xen) permettant de créer les services ci-après et assurant la sauvegarde des données propres à l’Observatoire ;
- un système de gestion de bases de données relationnelles PostgreSQL/PostGIS ;
- un serveur web destiné à accueillir les différents portails de l’Observatoire ;
- un serveur cartographique GeoServer et un serveur de catalogage GeoNetwork pour la diffusion standardisée des données spatialisées et des métadonnées ;
- un serveur Thredds de diffusion de données netCDF ;
- un serveur de données de type FTP.
Participation à la mise en place d’un SAN (Storage Access Network) mutualisé
L’OREME a participé à la mise en œuvre d’un SAN (Storage Access Network) dont l’objectif est de permettre le stockage pérenne de gros volumes de données accessibles via la fibre optique depuis différents laboratoires. L’Observatoire y a contribué par l’achat de matériel, de logiciels et de licences logicielles et par la gestion d’éléments physiques du SAN. Cette gestion repose en partie sur l’expertise et la disponibilité du personnel ASR de Géosciences Montpellier.
Ce SAN est aujourd’hui partagé par l’OREME et les laboratoires CEFE et GM. Il est composé d’un ensemble de baies de stockage configurées en RAID, de robots de sauvegarde et d’une interconnexion en fibre optique. L’espace de stockage constitué des disques présents dans les baies est accessible (en fibre optique) par des serveurs de gestion de données et de système de fichiers (bases de données, ftp, nfs, …) et par les serveurs de gestion des sauvegardes.
Cet espace de stockage partagé contient des données d’observation (relatives à l’observatoire) et des données propres aux laboratoires CEFE et GM (comptes utilisateurs, ftp, comptes projets, …). Concernant les données d’observation, la logique est que l’observatoire fournit l’infrastructure de stockage et de sauvegarde et les Systèmes d’Observation fournissent les disques. Néanmoins, ce schéma n’a de sens que pour des gros volumes de données, et le coût du stockage de petites bases (< 100 Go) est directement pris en charge par l’observatoire.
Constitution de listes de diffusion
La plateforme gère un certain nombre de listes et peut créer sur demande des listes de diffusion (propres à une équipe, un Service d’Observation, une thématique, …).
Participation au comité de pilotage du réseau CNRS SIST
La plateforme SI de l’Oreme est membre fondateur et exécutif du réseau technologique SIST de l’INSU, qui rassemble les gestionnaires de données d’observation dans les OSU et tous les autres établissements concernés (IFREMER, MNHN, etc).
Rapports des stages
Liste des rapports des stages effectués dans la plateforme.
Bureau 237 (2ème étage gauche), bâtiment HydroPolis
Faculté de Pharmacie
15 avenue Charles Flahault
34095 Montpellier
- Téléphone
- +33 (0)4 49 33 83 08
- si@oreme.org